BLAST工具，全称Basic Local Alignment Search Tool，是1990年由Altschul等人提出的一种用于生物序列比对的算法和程序 。它通过局部比对策略，在序列数据库中快速寻找与查询序列相似的片段，用于推断基因功能、进化关系等 。
1997年，该工具得到重大改进，引入了能处理空位的gapped blast和PSI-blast算法 。其常见的程序变体包括blastn、blastp、blastx、tblastn和tblastx 。
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